MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia parkeri str. Portsmouth chromosome

Total Repeats: 25017

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017044	ATA	2	6	247	252	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483342
2	NC_017044	CAA	2	6	257	262	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383483342
3	NC_017044	CAA	2	6	422	427	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383483342
4	NC_017044	TTA	2	6	446	451	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483342
5	NC_017044	AAAT	2	8	458	465	75 %	25 %	0 %	0 %	383483342
6	NC_017044	TGATA	2	10	557	566	40 %	40 %	20 %	0 %	383483342
7	NC_017044	AT	3	6	570	575	50 %	50 %	0 %	0 %	383483342
8	NC_017044	TAAA	2	8	582	589	75 %	25 %	0 %	0 %	383483342
9	NC_017044	ATAG	2	8	641	648	50 %	25 %	25 %	0 %	383483342
10	NC_017044	TTA	2	6	668	673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483343
11	NC_017044	TTA	2	6	759	764	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483343
12	NC_017044	AT	3	6	778	783	50 %	50 %	0 %	0 %	383483343
13	NC_017044	TAA	2	6	796	801	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483343
14	NC_017044	CTA	2	6	886	891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383483343
15	NC_017044	T	7	7	941	947	0 %	100 %	0 %	0 %	383483343
16	NC_017044	CTACT	2	10	1006	1015	20 %	40 %	0 %	40 %	383483343
17	NC_017044	TAT	2	6	1115	1120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483343
18	NC_017044	T	6	6	1120	1125	0 %	100 %	0 %	0 %	383483343
19	NC_017044	ATA	2	6	1147	1152	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483343
20	NC_017044	TAAT	2	8	1183	1190	50 %	50 %	0 %	0 %	383483343
21	NC_017044	AATATC	2	12	1250	1261	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	383483343
22	NC_017044	A	6	6	1272	1277	100 %	0 %	0 %	0 %	383483343
23	NC_017044	GAT	2	6	1287	1292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383483343
24	NC_017044	GTA	2	6	1299	1304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383483343
25	NC_017044	AAT	2	6	1329	1334	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483343
26	NC_017044	ATT	2	6	1335	1340	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483343
27	NC_017044	T	7	7	1355	1361	0 %	100 %	0 %	0 %	383483343
28	NC_017044	CTT	2	6	1375	1380	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383483343
29	NC_017044	TCT	2	6	1425	1430	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383483343
30	NC_017044	CTC	2	6	1472	1477	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383483343
31	NC_017044	AGA	2	6	1493	1498	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383483343
32	NC_017044	ACC	2	6	1502	1507	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383483343
33	NC_017044	T	6	6	1522	1527	0 %	100 %	0 %	0 %	383483343
34	NC_017044	T	6	6	1532	1537	0 %	100 %	0 %	0 %	383483343
35	NC_017044	CT	3	6	1538	1543	0 %	50 %	0 %	50 %	383483343
36	NC_017044	ATT	2	6	1554	1559	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483343
37	NC_017044	ATA	2	6	1566	1571	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483343
38	NC_017044	ATTA	2	8	1592	1599	50 %	50 %	0 %	0 %	383483343
39	NC_017044	ATAGA	2	10	1610	1619	60 %	20 %	20 %	0 %	383483343
40	NC_017044	T	6	6	1650	1655	0 %	100 %	0 %	0 %	383483343
41	NC_017044	TTCTT	2	10	1687	1696	0 %	80 %	0 %	20 %	383483343
42	NC_017044	CTTTC	2	10	1785	1794	0 %	60 %	0 %	40 %	383483344
43	NC_017044	GAA	2	6	1802	1807	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383483344
44	NC_017044	T	6	6	1817	1822	0 %	100 %	0 %	0 %	383483344
45	NC_017044	TAA	2	6	1826	1831	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483344
46	NC_017044	TAA	2	6	1845	1850	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483344
47	NC_017044	CACTC	2	10	1889	1898	20 %	20 %	0 %	60 %	383483344
48	NC_017044	T	7	7	1904	1910	0 %	100 %	0 %	0 %	383483344
49	NC_017044	CTT	2	6	1952	1957	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383483344
50	NC_017044	AAT	2	6	1975	1980	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483344
51	NC_017044	CTT	2	6	2024	2029	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383483344
52	NC_017044	T	6	6	2047	2052	0 %	100 %	0 %	0 %	383483344
53	NC_017044	GAT	2	6	2156	2161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383483344
54	NC_017044	T	6	6	2168	2173	0 %	100 %	0 %	0 %	383483344
55	NC_017044	TAA	2	6	2177	2182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483344
56	NC_017044	TAA	2	6	2187	2192	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483344
57	NC_017044	TTC	2	6	2193	2198	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383483344
58	NC_017044	TATTT	2	10	2205	2214	20 %	80 %	0 %	0 %	383483344
59	NC_017044	AT	3	6	2217	2222	50 %	50 %	0 %	0 %	383483344
60	NC_017044	T	6	6	2226	2231	0 %	100 %	0 %	0 %	383483344
61	NC_017044	TTTTCC	2	12	2250	2261	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383483344
62	NC_017044	TCA	2	6	2276	2281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383483344
63	NC_017044	T	7	7	2334	2340	0 %	100 %	0 %	0 %	383483344
64	NC_017044	T	7	7	2343	2349	0 %	100 %	0 %	0 %	383483344
65	NC_017044	ATT	2	6	2350	2355	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483344
66	NC_017044	GATT	2	8	2384	2391	25 %	50 %	25 %	0 %	383483344
67	NC_017044	TCT	2	6	2407	2412	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383483344
68	NC_017044	AT	3	6	2492	2497	50 %	50 %	0 %	0 %	383483344
69	NC_017044	A	6	6	2501	2506	100 %	0 %	0 %	0 %	383483344
70	NC_017044	TTGCT	2	10	2558	2567	0 %	60 %	20 %	20 %	383483344
71	NC_017044	CAT	2	6	2570	2575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383483344
72	NC_017044	T	6	6	2593	2598	0 %	100 %	0 %	0 %	383483344
73	NC_017044	GTT	2	6	2599	2604	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383483344
74	NC_017044	T	6	6	2613	2618	0 %	100 %	0 %	0 %	383483344
75	NC_017044	TAT	3	9	2669	2677	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483344
76	NC_017044	ATT	2	6	3116	3121	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483345
77	NC_017044	TAT	2	6	3285	3290	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483345
78	NC_017044	ATT	2	6	3377	3382	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483345
79	NC_017044	T	6	6	3396	3401	0 %	100 %	0 %	0 %	383483345
80	NC_017044	ATG	2	6	3495	3500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383483345
81	NC_017044	ATA	2	6	3536	3541	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483345
82	NC_017044	GTA	2	6	3677	3682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383483345
83	NC_017044	TTA	2	6	3690	3695	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483345
84	NC_017044	CAG	2	6	3870	3875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383483345
85	NC_017044	TAA	2	6	3879	3884	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483345
86	NC_017044	AT	3	6	3890	3895	50 %	50 %	0 %	0 %	383483345
87	NC_017044	A	6	6	3904	3909	100 %	0 %	0 %	0 %	383483345
88	NC_017044	ATA	2	6	3915	3920	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483345
89	NC_017044	ATA	2	6	4257	4262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483346
90	NC_017044	AAAGTA	2	12	4290	4301	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	383483346
91	NC_017044	TGA	2	6	4316	4321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383483346
92	NC_017044	GTA	2	6	4354	4359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383483346
93	NC_017044	CAA	2	6	4416	4421	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383483346
94	NC_017044	A	7	7	4420	4426	100 %	0 %	0 %	0 %	383483346
95	NC_017044	TAA	2	6	4445	4450	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483346
96	NC_017044	TCT	2	6	4565	4570	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383483347
97	NC_017044	A	6	6	4573	4578	100 %	0 %	0 %	0 %	383483347
98	NC_017044	TC	3	6	4583	4588	0 %	50 %	0 %	50 %	383483347
99	NC_017044	A	6	6	4643	4648	100 %	0 %	0 %	0 %	383483347
100	NC_017044	AT	3	6	4708	4713	50 %	50 %	0 %	0 %	383483347
101	NC_017044	TA	3	6	4826	4831	50 %	50 %	0 %	0 %	383483347
102	NC_017044	ATA	3	9	4829	4837	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483347
103	NC_017044	A	7	7	4855	4861	100 %	0 %	0 %	0 %	383483347
104	NC_017044	GTA	2	6	4895	4900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383483347
105	NC_017044	TGA	2	6	4995	5000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383483347
106	NC_017044	GAA	2	6	5052	5057	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383483347
107	NC_017044	AAT	2	6	5082	5087	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483347
108	NC_017044	AAG	2	6	5099	5104	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383483347
109	NC_017044	TTA	2	6	5137	5142	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483347
110	NC_017044	CAA	3	9	5200	5208	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383483347
111	NC_017044	T	8	8	5232	5239	0 %	100 %	0 %	0 %	383483348
112	NC_017044	A	6	6	5242	5247	100 %	0 %	0 %	0 %	383483348
113	NC_017044	T	6	6	5307	5312	0 %	100 %	0 %	0 %	383483348
114	NC_017044	T	6	6	5367	5372	0 %	100 %	0 %	0 %	383483348
115	NC_017044	T	6	6	5376	5381	0 %	100 %	0 %	0 %	383483348
116	NC_017044	GA	3	6	5394	5399	50 %	0 %	50 %	0 %	383483348
117	NC_017044	CGG	2	6	5421	5426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383483348
118	NC_017044	AGC	2	6	5452	5457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383483348
119	NC_017044	ATA	2	6	5497	5502	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483348
120	NC_017044	A	7	7	5502	5508	100 %	0 %	0 %	0 %	383483348
121	NC_017044	T	7	7	5526	5532	0 %	100 %	0 %	0 %	383483348
122	NC_017044	TA	3	6	5558	5563	50 %	50 %	0 %	0 %	383483348
123	NC_017044	TTTTA	2	10	5598	5607	20 %	80 %	0 %	0 %	383483348
124	NC_017044	ATA	2	6	5635	5640	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483348
125	NC_017044	TAA	2	6	5666	5671	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483348
126	NC_017044	TG	3	6	5674	5679	0 %	50 %	50 %	0 %	383483348
127	NC_017044	TTAT	2	8	5759	5766	25 %	75 %	0 %	0 %	383483348
128	NC_017044	AT	3	6	5818	5823	50 %	50 %	0 %	0 %	383483348
129	NC_017044	ATG	2	6	5896	5901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383483348
130	NC_017044	TAT	2	6	5916	5921	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483348
131	NC_017044	TTA	2	6	5930	5935	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483348
132	NC_017044	ATTTA	2	10	5951	5960	40 %	60 %	0 %	0 %	383483348
133	NC_017044	TTAT	2	8	5981	5988	25 %	75 %	0 %	0 %	383483348
134	NC_017044	A	6	6	6045	6050	100 %	0 %	0 %	0 %	383483349
135	NC_017044	CTC	2	6	6127	6132	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383483349
136	NC_017044	TC	3	6	6131	6136	0 %	50 %	0 %	50 %	383483349
137	NC_017044	ATT	2	6	6138	6143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483349
138	NC_017044	ATT	2	6	6151	6156	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483349
139	NC_017044	T	6	6	6194	6199	0 %	100 %	0 %	0 %	383483349
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285	NC_017044	T	6	6	15066	15071	0 %	100 %	0 %	0 %	383483355
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